阿爾金山國家級自然保護區(qū)有國家一級保護動物17種，活躍著藏野驢、野牦牛、藏羚羊、藏原羚、鼠兔、黑頸鶴等珍稀動物，生物多樣性日益豐富。據(jù)2022年科考統(tǒng)計，這里有野牦牛近1.2萬頭，藏羚羊約6.5萬只，藏野驢約5萬頭。